如果機動車登記證丟失了，車主需要按照以下步驟進行補辦：

1. 準備相關資料并前往車管所：車主需要攜帶有效身份證件、車輛所有權證明等必要資料，前往車輛注冊地的車管所或服務站辦理補辦手續(xù)。

2. 車輛查驗：在車管所或服務站，車主需要將車輛駛入專門的查驗通道，并前往查驗點進行車輛查驗。車管所工作人員將對車輛進行仔細的檢查，以確保車輛信息與原登記信息一致。

3. 確認信息并辦理手續(xù)：完成車輛查驗后，車主需要到查驗服務處確認車輛信息，并前往業(yè)務大廳導辦服務臺辦理相關手續(xù)。在此過程中，車主需要排隊等待辦理，并根據(jù)工作人員指示完成相關手續(xù)。

4. 繳費并取證：完成手續(xù)后，車主需要攜帶受理憑證前往收費窗口繳納相關費用。最后，車主需要到取證窗口打印新的機動車登記證書，完成整個補辦流程。